9月16日，上海市气象局发布最新消息，台风“贝碧嘉”于中午12时抵达江苏昆山境内，其东侧环流持续对上海造成影响。整个下午，上海预料将经历风雨天气，尤其是东部地区首当其冲，风雨稍晚些时候会有所减弱。对于全市大部分区域而言，风雨预计将持续至晚间，市民被提醒需持续采取防范措施。
同日，上海中心气象台指出，“贝碧嘉”在上午9时减弱为台风级别，10时台风中心定位在闵行区，坐标北纬31.1度、东经121.4度，风力核心达13级（38米/秒），中心最低气压975百帕。气象台预测，直至傍晚，上海仍会遭受显著风雨侵袭，建议公众保持警惕。
目前，上海市暴雨预警等级已提升至橙色：受第13号台风“贝碧嘉”波及，接下来6小时，上海大部分地区的累计降水量预计将超100毫米，由暴雨黄色预警升级为橙色。强降雨可能导致城市内涝、农田受损及交通阻塞等，灾害风险极高，需特别强化防御措施。
受“贝碧嘉”影响，从前日晚20时至今日10时，上海中东部普遍出现大雨，东南部更是遭遇暴雨乃至大暴雨，其中，浦东南汇新城镇记录到129.5毫米的大暴雨量。此外，全市多数地区最大阵风超过6级，崇明陈家镇录得罕见的陆地13级阵风。
今日早晨，台风“贝碧嘉”主体带来的强风雨使浦东奉贤区域遭遇最严峻状况，浦东南汇新城镇在短短一小时内降雨量激增至72.0毫米（时间区间为16日08时45分至09时45分）。